中文

English

分子克隆流程与注意事项—Z6·尊龙凯时定点突变指南

发布时间:2025-03-26   信息来源:尊龙凯时官方编辑

Z6·尊龙凯时的定点突变引物设计与PCR扩增步骤如下:

分子克隆流程与注意事项—Z6·尊龙凯时定点突变指南

一、引物设计要求

引物应包含5’-15-21bp反向互补区域以及至少15bp的非互补区域,反向互补区域的GC含量需在40%-60%之间。此外,待突变位点应位于引物3’端,且其Tm值应达到60°C。根据实验需求,选择适当的模块设计引物。

二、PCR扩增

建议搭配使用适合的试剂盒进行PCR扩增,并根据实验情况摸索合适的退火温度,同时优化反应体系和程序。模板质粒的推荐投入量为50μl反应体系中加入1ng,扩增循环数应限制在35个以内。

三、扩增产物的DpnI消化和纯化

1. 取5μl扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳鉴定,以确认目的条带的存在;随后,使用DpnI对剩余产物进行消化(将45μl扩增产物与1μl DpnI混匀,置于PCR仪中37°C反应1-2小时,然后在70°C下反应15分钟以失活DpnI)。

2. 推荐采用切胶回收的方式进行纯化,切胶时间应尽量控制在3分钟内,以减少紫外线对DNA的损伤。使用NanoDrop或OneDrop等仪器检测回收浓度,应达到≥20ng/μl,并进行电泳以确认回收产物为单一条带。

3. 若回收浓度低,可通过增加反应体系并采用多管反应单管回收的技巧,以提高最终产品的浓度。

四、重组反应

1. 根据说明书要求计算连接反应体系中的投入量,各组分的体积应至少为1μl,若浓度过高,可适当稀释。

2. 按照说明书的要求进行连接反应程序,建议在PCR仪中执行反应。

五、感受态转化

1. 对于连接产物,推荐使用DH5α、Fast-T1等适合克隆用途的化学感受态细胞。

2. 感受态细胞不应重复冻融,-80°C取出后建议一次性使用完毕。

3. 重组产物与感受态细胞的体积比例应为1:10,建议10μl重组产物加入至100μl感受态细胞,或5μl重组产物加入至50μl感受态细胞。

4. 热激时间应根据感受态细胞的说明书进行操作。

5. 平板抗生素的抗性要与转化载体保持一致。

6. 在涂板前,将菌液离心(2500×g,3分钟),然后去除多余的LB培养基,保留100μl重悬液进行涂板,或选择适量的体积进行操作。

六、常见问题处理

1. 若质粒模板无法正常扩增,需检查引物设计是否存在问题:反向互补区域的长度应在15-21bp之间,GC含量应在40-60%范围内。可使用Z6·尊龙凯时提供的CEDesign在线设计工具帮助确认引物质量。

2. 如果质粒模板质量较差,需通过凝胶电泳检测模板,若出现开环、线性条带或拖尾等情况,需重新制备模板。

3. PCR反应体系或程序设置不当,过多的质粒模板可能抑制PCR反应,建议在50μl体系中使用1ng的模板;根据上下游引物的Tm值设定适宜范围进行梯度摸索。如果质粒长度超过8kb,建议考虑采用双/多点突变策略进行分段扩增。

4. 若非目标位点发生碱基突变,特别是引物处的突变,建议重新合成引物并进行实验;对于其他位置的突变,建议使用高保真酶重新制备模板后再次进行实验。