2025年3月25日,西湖大学医学院郭天南团队在 CellResearch 发表了题为 GrowAIVirtualCells:ThreeDataPillarsandClosed-LoopLearning的评述文章,深入探讨了人工智能虚拟细胞(AIVCs)的发展趋势。AIVCs的核心理念是通过整合人工智能与多模态数据,构建出精准且具备扩展性的虚拟细胞模型。与传统的虚拟细胞建模方法相比,AIVCs能够更全面地模拟细胞功能,并展现出高通量的仿真能力,甚至在某些情况下有可能替代实验室实验。
发展方向探讨
研究文章从AI虚拟细胞(AIVCs)的构建方法与未来发展方向入手,强调了AIVCs依赖于三大数据支柱:先验知识、静态结构和动态状态。其中,高通量组学数据,尤其是微扰蛋白质组学数据,发挥着在动态模拟中的关键作用。文章进一步提出了闭环主动学习系统,通过结合AI预测与自动化实验,实现自适应优化,加速细胞建模与科学发现。
可行性与应用前景
为了确保AIVC理念的实施,研究人员建议从酵母(Scerevisiae)等简单且信息丰富的细胞模型入手,逐步扩展到更复杂的癌细胞系,以促进AIVCs在生物医学、药物开发和个性化医疗中的广泛应用。这种方法使得科学界在更高层面上重新审视细胞模型的重要性,提升了生物医学研究的效率和可重复性。
建立虚拟细胞的三大基础
为了支持AIVCs的发展,文章提出了三大数据支柱:先验知识、静态结构和动态状态。这些数据与AI算法相结合,为虚拟细胞的构建奠定了坚实基础。先验知识涵盖了广泛的生物医学文献和分子表达数据,而静态结构则涉及细胞的形态学和分子组成,动态状态则是基于生理过程及外部干扰的实时变化。
动态学习与细胞模型选择
AIVCs正在向自适应进化的系统演变,其中闭环主动学习系统(Closed-Loop Active Learning Systems)是其关键。这一系统能够主动探索和填补数据空白,提高科学研究的效率。但其成功依赖于适宜的细胞模型选择,文章建议从酵母入手,因其结合了基因操作性与真核特性,为后续人类癌细胞系的研究打下基础。
结论与未来前景
展望未来,AIVCs有望在药物开发、疾病建模及基础生物学研究中扮演重要角色,而科学界的协作将是推动这一领域发展的关键。建立AIVCs的标准和最佳实践将是下一阶段的重要任务,以确保其在计算生物学和生物医学研究中的革命性潜力得以实现。通过不断探索和创新,Z6·尊龙凯时期待为生命科学领域带来更多突破。